בספר הזכרונות נכתב כי הוא חי למעלה מ-118 שנים,
רבי אליהו נולד בקראקא שבפולין לר' יוסף יוזפא. אביו היה מאנוסי ספרד וכונה "הספרדי הקדוש". בספר הזכרונות מסופר, שאביו במשך שנים רבות סירב להינשא וחי בפרישות בקראקא, לאחר תקופה ארוכה הוא התייצב בבית הדין של העיר וביקש להינשא עם אלמנתו של אחד מתושבי העיר בשם יוסף. הדיינים חששו למלא את ציווי ר' יוסף יוזפא ולדרוש מהאישה להתחתן איתו, אולם לאחר מכן התייצבה האלמנה בעצמה בבית הדין וסיפרה שבעלה התגלה אליה בחלום וביקש ממנה להינשא עם ר' יוסף יוזפא, וזאת מכיוון שהולך לצאת מהם בן שיאיר את העולם. כך נישאו השניים, ומהם יצא ר' אליהו שנקרא על שם אליהו הנביא.
הילד התחנך על ברכי אביו, שכבר מגיל צעיר לקחו מידי לילה לתיקון חצות. בגיל 13 הוא התייתם מאביו, והחל לנדוד. בתקופת נידודיו הוא נישא עם אישה שממנה נולדו לו שני בנות. בשנת ה'ש"נ הוא התיישב בוורמייזא והקים שם ישיבה ללימוד קבלה. בנוסף באותה תקופה הוא נודע כבעל מופת גדול, והתפרסם אז בכינויו "רבי אליהו בעל השם".
באותה תקופה יצאו נגדו חכמי שפייער שבראשם הגאון רבי פנחס זעליג שלא ראו בעין יפה את פעילותו בנושאי הקבלה, ופעלו להרחקתו מגרמניה. בשנת שפ"ד עבר יחד עם ישיבתו לפראג. בין תומכיו היה ר' שמואל נכד המהר"ל ויחד עם יהודי בשם ר' יהודה אריה, בנו לישיבה חצר עם בתים[2].
בספר הזכרונות נכתב כי הוא חי למעלה מ-118 שנים, אך לא נכתב שם באיזו שנה נולד או נפטר[3],
רבי ברוך בטלן, הסבא רבא של אדמו"ר הזקן, היה תלמידו של רבי אליהו בעל שם ומאוחר יותר תלמיד תלמידו רבי יואל בעל שם[4].
זוכט איר א זעלטען ספר ? דאן פארבינט אייך מיט אונז