Windows パーティションとは別のパーティションに Windows 回復環境 (Windows RE) などの回復ツールをインストールすることを検討してください。こうすると、エンド ユーザーは回復ツールを削除しなくても Windows を修復または再インストールすることができます。Windows RE をインストールする場合は、システム パーティションにインストールすることをお勧めします。
回復ツールをインストールしておくと、Windows を起動できなくなった場合に Windows ブート マネージャーを構成し、回復ツールにフェールオーバーすることができます。