分子（molecule）を、整える（ortho-）治療法ということを意味しています。

分子とは、体の細胞を構成している分子
体内で行われている反応に関係する　酵素やホルモンを構成する分子
それらの反応に必要な補酵素である　ビタミンやミネラルなどのことです。

それらの細胞を構成し、細胞を機能させる物質の材料となる分子を
人の身体にとって　必要な最適な量を投与することによって
様々な病態を改善させるのが、オーソモレキュラー療法だそうです。

整合（オーソ、ortho）という言葉は、“正しい”あるいは“最良”を意味する
分子疾患を適正な療法で治療するには、体内に正常に存在している分子を使う必要がある

あるものが欠けているという状態を治すには、欠けているものを補う以外の方法はできない
何かが過剰で起きている現象は、過剰分を取り除けばよい

ある酵素の欠乏を、薬で置き換えることはできない
体内での生化学的反応に何かが欠けていることで起こる疾患、すなわち
分子疾患は、毒性分子（薬）では治らない

分子整合というのは　「正しい分子を　正しい量で」という意味
健康を維持し　病気を治すために、体内に存在している物質の　最適な濃度を供給する

「ビタミンのような、人体に正常に存在している物質の濃度を変えることで、
　精神的健康を達成し維持すること、それが分子整合医学のもっとも大きな
　テーマの一部分である。おそらく脳の機能は、他の器官の機能よりも
　もっと敏感に、分子的構成と構造に依存しているだろうからである」
　　　　　－ライナス・ポーリングの分子整合精神医学の定義