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2010.05.28
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カテゴリ: 生命科学

大山「領域会議」3日目 最終日



朝5時半起床、カーテンから洩れる朝の光のなか、今日のパワポを整備する。なかなかめんどくさい。

米子の近所ということで、

さて、ところで天然変性蛋白質に関して、Piyotaの前後の発表に関して、議論が起こった。

「天然変性蛋白質領域の定義にヘテロNOEを使うのはどうか?」という何人かの先生からの意見に対する、現時点でのPiyotaが反論(慎重論)したので、それについて議論が起こったのである。

1H-15N NOEは、基本的にはナノ秒程度の蛋白質主鎖の運動を反映する、と考えられている。NMRで構造解析用の試料を調製したときのN/C末端のリンカーなど、しばしばNOE情報の不足で収束しないことが起こるが、その際に本質的にふらふらしていて収束しないのか、情報収集が不足していないせいで収束しないのか、よりまじめに厳しく判定するのならば、ヘテロNOEの情報を採用するのがよい。

そのことに関して、否定はしない。

ただし、現時点で多くの情報科学者・機能生物学者・細胞生物学者の人々が興味を持っている、「(自称)天然変性蛋白質(領域)」は、ナノ秒オーダーで柔軟な部位という定義ではない、ような気がするのだ。というか、分子複合体内や核内の環境や分子クラウディングなどの環境因子がある場合、主鎖の構造の「運動性」が問題なのか、それとも「多形性」が問題なのかは、まだ結論を保留しておいたほうがいいのではないか?少なくともシミュレーションの人の主張は、「運動性」ではなく、「エネルギー地形における障壁の低さ」であった(どちらかといえば多形性の概念に近いと解釈した)。

議論百出!というのが、面白いところだとおもう。

これからますます国内では局所的にもりあがる「蛋白質天然変性」、やはり実に面白いと思うのだが・・・

米子駅前アーケードと「先端科学で雇用創出」の難しさ

岡山行き特急やくもまで時間があったので、米子駅前を散策する。シャッターが目に付くアーケードを歩いて、やや、暗澹たる気分になる。境港とちがって「ゲゲゲ」効果もあまり感じられない。全国的に不景気な日本の状況もなんとかしたいが、こう、どんどん弱っていく地方の主要都市についても、なんとかしたいと、思う。こうなると残るのは一次産業しかないのだろうか?

一次産業のみならず、工業あたりまでも含めて、付加価値の高いものを売る、という観点で伸ばしていかないといけないのではなかろうか?しかし、医薬品以外に付加価値の高いものなんか、バイオで作れるのだろうか?そういえばGMOに関する基本特許や基礎技術や最先端技術の開発のノウハウなど、日本国内ではどれくらい技術蓄積が進んでいるのであろうか? 「遺伝子組換えアレルギー」を消費者が持っている、ということと、「それを研究開発する人材を国内で育成しない」という戦略決定とは、本来別次元で行わなければまずいんだと思うのだけれども・・・・。そんなこんなを、蕎麦屋から米子まで散策する間、Q大のI先生と、いろいろと話す。日本の生命科学やバイオテクノロジー研究と施策などについて、いろいろと愚痴を聞いてもらい、意見交換する。とても勉強になる。

しかし、この(基礎科学と応用科学の)問題は難しいなあ。ひとつ確かなのは基礎研究が二流の状態でいくら応用を謳ったところで、しばしば金と時間の無駄にしかならない点だ。日本のバイオベンチャーが一時期陥りがちであった事情に、通ずるものがある。

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最終更新日  2010.06.02 10:26:03 コメントを書く


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