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2011.03.25

openmpiのインストールでハマる

カテゴリ： linux

クラスタのセットアップで、openmpiのインストールに苦戦した。

適当にインストールしたら、intel compilerを利用していないことに気づく。
openmpiを展開したディレクトリで、
# ./configure FC=ifort F77=ifort F90=ifort
# su
# make all install

mpirunをシングルノードで実行するが、/usr/local/libにあるはずのライブラリがないというエラーが出る。
# echo /usr/local/lib >> /etc/ld.so.conf
# ldconfig

rsh-serverをインストールしてあるのに、rshを用いないで、sshを使っているようだ。
# mkdir $HOME/.openmpi
# echo plm_rsh_agent=/usr/bin/rsh > $HOME/.openmpi/mca-params.conf
あるいは、
# echo plm_rsh_agent=/usr/bin/rsh >> /usr/local/etc/openmpi/etc/openmpi-mca-params.conf

これでも、まだ、ortedがないというエラーが出る。
/usr/local/binを読みにいっていないようだ。
/usr/local/binをpathに含める。

やっと動いた。

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