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2007年11月の記事
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循環論
研究を進めていく中で循環論に陥ることがたまにある。今日Ｍ助教とディスカッションしていて問題になったのは、種の同定法の確立と種の同定のこと。僕は今まで形態の似た２種（このブログでは今のところ研究対象の生物名を出さないようにしているので、仮にIとSとする）の動物の研究をしてきたが、常にこの２種をどうやって同定するかという問題がつきまとっている。哺乳類の場合、たいてい頭骨と毛皮が標本として保存されるので、頭骨か毛皮のどちらかから種同定が出来ればいい。しかし、頭骨標本しか保存されていない場合とか毛皮標本しか保存されていない場合もある。同定の問題をはっきりさせるために、頭骨標本からの種の同定法に関する論文を書こうと思っているのだが、そもそも研究に使ったサンプルはどうやって同定したのかが問題になる。この問題は、今使っているサンプルに関しては毛皮標本で同定して解決されているのだが、他のサンプルを見る場合に頭骨標本しかない場合にどうするかが問題となる。これが種の同定法と種の同定の循環論。標本を見たときにＩとＳは見た目でほぼ区別できるのだが、科学的根拠を以て同定基準を示すのは難しい。DNAを使えばはっきりと区別できるから、これから集めるサンプルは筋肉とか血液を保存しておけばいい。でも、古い標本はDNAが採取できるものを保存していない場合が多い。分類に関わった多くの先人たちは、組織からDNAを取り出して塩基配列を調べることで種同定が出来るなんて考えもしなかっただろう。それが今では比較的簡単にできるようになった。それにコストも安くなっているようだ。DNA実験なんて学部の実習以来やってないけど、簡単なことくらいはやることになるかもしれない。結局、同定の問題は今書いている論文には入れないことにした。まだ問題が十分に解決していないし、分かりやすい論文にするためにもまた別の機会に書くことにしよう。今書いている論文のことで、他にももう１つ問題があって前途多難…一人前の研究者になるにはきっとたくさんの難題を解決していかなければならないのだろう。それが出来なければ、挫折していった他の人たちと同じようにデータをお蔵入りさせてやってきたことを無駄にしてしまう。研究成果を公表しないことは科学者として罪である。と言ったら言い過ぎだろうか？
2007.11.26
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高山寺の紅葉
紅葉を見に高山寺に行ってきた。高山寺は今回が初めて。今年の桜の時期に寺の下まで行ったが、午後５時を過ぎていて入れなかった。あのときは下の駐車場の山桜を見て帰ってきた。高山寺はモミジが有名らしく、晩秋が一番いいようだ。そのため、今の時期は観光客が多く下の駐車場は有料だった。まさか800円も取られるとは思わなかった。それに、駐車場に車を停めるのに少し待たされた。駐車場には観光バスが何台も停まっていた。年配の観光客を中心にたくさんの人で賑わっていて、月曜日のわりには人が多かった。さて、肝心の紅葉だが色づきがイマイチだった。少し早かったのか？それとも、今年の紅葉はあまり良くないのか？国宝の石水院の庭のモミジ。あまり良い写真が撮れなかった。紅葉以外に高山寺の見所と言えば鳥獣戯画だが、石水院にあるのは全部レプリカ。全４巻のうち、甲・丙巻は東京国立博物館、乙・丁巻は京都国立博物館にある。上の写真は鳥獣戯画の乙・丙・丁巻のレプリカ。残念ながら、世界文化遺産高山寺はイマイチ見所が無かった。むしろ、周山街道沿いの紅葉の方が見ていて楽しかった。
2007.11.19
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桜の紅葉
桜と言えば春。４月の初旬の琵琶湖疎水沿いの桜並木は何度見ても良い。満開の桜も良いが、秋の桜も良い。秋の桜と言っても「秋桜（コスモス）」ではなく、桜の紅葉のこと。疎水沿いが赤く染まっている。京都のモミジの紅葉はまだ見頃には少し早いところが多いようだ。
2007.11.17
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早起き
今朝は一番早く研究室に来た。誰もいない研究室は静かでよい。向かい側の部屋のＭ助教もまだ来ていない。昨日は11時くらいに寝て、３時間半くらい寝た。それしか寝てないのに、良い目覚めだった。ただ、少し目の疲れが残っていたが、温めたタオルで目を温めたらだいぶ良くなった。今日もこれから論文を書く作業を始める。早く完成させられるといいなぁ…
2007.11.16
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Я изуцаю русский язык
今日はかなりの時間、論文を書くのに費やした。昨日から一睡もせず、昼間で作業しお昼を食べた後に20分だけ昼寝した。昼寝は午後３時までに20分くらいがちょうど良いらしい。３時以降に昼寝すると夜眠れなくなるということだ。実際に20分はちょうど良かったように思える。午後も論文を書くのに集中できた。でも、ずっと作業を続けていると飽きてくる。そういうときにはロシア語の勉強をする。ロシア語を勉強しているのは、読まなければいけないロシア語の論文があるし、来年ロシアに調査に行くかもしれないから（旅費は何とかなるのだろうか…？）。でも、そんなこととは関係なく語学が好きだ。世の中には語学が嫌いな人間が多いようなので、そう言うと「はぁ？」って感じの反応をされることがあるが…と言っても、学部の一回生の頃はあまり語学が好きじゃなかった。学部時代、第二外国語はドイツ語を取っていたがあまりやる気がなかった。何で第二外国語を勉強するのか？と思っていたし、そもそも英語が嫌いだった（アメリカが嫌いだから）。今は第二外国語をやる理由が何となく分かる。外国語を２つ以上学ぶことで、視野を広げることが出来るし、新しいことを知るのは楽しい。もちろん僕の場合、実用的な理由が大きい。ロシア語と中国語が出来れば、ロシアや中国の研究者とコミュニケーションが取りやすくなって、協力が得やすくなるかもしれない。タイトルの意味は「私はロシア語を勉強しています」。スペル間違ってたらごめんなさい。
2007.11.15
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自分で締め切りを決める！
昨日はなかなか眠れず、やっと今朝になって眠ることが出来た。そして、起きたのは昼過ぎ。朝から研究室に行こうと思っていたのに行けず、憂鬱な気分になった。相変わらず生活が不規則で困っている。寝るべき時に寝て、起きていたいときに起きていられればいいのだが、なかなかそうはいかない。ところで、ナポレオンは３時間で十分な睡眠が取れたという。睡眠は時間ではなく、質が重要らしくこれが本当ならナポレオンは効率的に眠っていたことになる。３時間睡眠が出来れば…論文の締め切りを来月の12日に設定して、今日から本格的に書き始めた。これから１ヶ月で論文を書き上げるためには時間を無駄に出来ない。とりあえず、今日の午前中の貴重な時間を取り戻すために徹夜することにした。眠くないのに寝ようと努力して時間を費やすのは無駄だから…誰もいない夜中の研究室は静かで比較的集中しやすい。自分の部屋でやるよりも遙かに仕事が進みそうだ。
2007.11.14
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自分で考えるしかない。
研究者というのは、自分で考えて自分の力で研究を進めていかなければならないものだ。大学などで研究している人の多くにとっては、当たり前のことだろう。しかし、問題がなかなか解決できないときにどうした良いか？指導教官が「親切に」解決方法を教えてくれるようなところもあるだろう。僕の指導教官は答えを教えてはくれない。その理由の１つは個人プレ－が普通の研究室なので、指導教官の研究と、僕の研究に直接関係がないからだろう。もう１つは学生に実力を付けさせるためだろう（こっちが主な理由だと信じているが…）。ディスカッションの中にヒントがある。これに気づき考えることで、進歩することを望んでいるはずだ。それが出来なければ、いつの間にか研究の世界から消えていくことになるだろう。良かれ悪しかれ、「放任主義」、「自己責任」はうちの研究室の伝統だと思われる。あまり大きな声では言えないが、これは優秀な研究者を輩出出来る可能性がありながら、たくさんの「落ちこぼれ」を生み出すやり方なのだと思う。どうしたら、前者（例えばＭ助教）のようになれるか？放任主義とはいえ、教官には学生を指導する義務がある（はず）。でも、教官があれをやれ、これをやれとは言わない。あれをやった方がいい、これをやった方がいいともあまり言わない（少しは言う）。ならば、積極的に指導教官とディスカッションをするように努めなければいけないと思う。今日は、昨日のゼミのことを助教に相談した。ほとんど昨日と同じことを言われた。おかげで、昨日言われたことの理解は深まった。しかし、今のところ解決方法は見いだせていない。そもそも、Ｍ助教の見解がやや否定的だったから方法などを改善してもうまくいかないかもしれない。ちなみに、Ｍ助教はうまくいくかもしれないと思ったら、「やってみたらいいんじゃない」と言う。仮にうまくいけば、たぶん１本論文が書けるが今のところそこまで発展させられる見込みはない。それと、論文のことを相談した。期限を決めて書くこと、書く前に投稿する雑誌を決めることをすすめられた。投稿する雑誌はほとんど決まっている（と言うよりもそんなに選択肢はない）。とりあえず、投稿したい雑誌の投稿規定を読んでみた。これから、急いで書かなければいけない。学振の準備を本格的に始める来年の４月までに間に合うだろうか。
2007.11.13
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終わった！！
年に２回のゼミ発表が終わった！これでしばらく投稿論文を書くのに集中できそうだ。と言っているうちに、また何かやらなければならないことが出てくるかもしれないが…とりあえず発表が終わってほっとしたが、その反面今の自分がとても情けなく思えた。というのは、今回の発表にかなり問題があったため。１ヶ月前に今日発表することが決まってすぐに準備を始めたのだが、結局中途半端な内容になってしまった。博士課程の院生としては実に不甲斐ない。この程度の実力で博士課程に進学して良かったのだろうか？そんなことを思ってしまった。半年前、今年１回目のゼミの前にサークルの先輩Ｋ氏に同じようなことを言われたのに…今日はＭ助教（直接の指導教官）に「年に2,3回の発表なんだからもっとしっかりやらないとね」と言われてしまった。時間が足りなかったと言い訳したくなるが、そんなことを言っていたらいつまでも博士になれないだろう。もっと研究に専念しなければいけないと、改めて感じた。今回のゼミで何が一番の問題だったかというと、目的と方法と結果が対応していないこと。目的は「分類」なのに、方法が「変異」を調べる方法で、結果ははっきりしないという最悪の内容だった。本当は「分類」と「変異」の両方を議論するはずが、準備が間に合わなかった。また、方法に問題があった。これは自分自身で認識できていたこと。これに気づいて２週間くらい前は準備をする気力が減退していた。方法とは、標本の写真を撮って色を調べるというもの。夏に中国で調査をしたときにこの方法を使ったのだが、あまり信頼できない写真が多かった。調査時間が限られていたために、写真がうまく撮れているかチェックする時間がなかったのが原因。中国に行く前に、色々試しておきたかったが要領が悪くて出来なかった。何よりも、僕のカメラに関する知識のなさが一番の問題。今日のゼミでは、今年博士を取ったＯさんから色々とコメントを貰えて少し知識が増えた。色々と知っているので、Ｏさんからは毎回とても有益なコメントをいただいている。ありがたいことだが、自分の無知にはがっかりする。
2007.11.12
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目処は立った
ゼミ発表まであと２日を切った。ここ３日ほどは毎日徹夜だ。徹夜して朝家に帰って昼か夕方まで寝る。寝たら結局徹夜の意味が無いのに！昨日は夕方起きて、研究室に行った。１日帰らないつもりで。そして、１時間前に帰ってきた。約30時間帰らなかったことになる。これだけ頑張ったのは久しぶり。その甲斐あって、だいぶ準備が進んだ。ゼミの準備をしていて最初が一番辛いと感じた。何を話すか色々と考えるのだが、どうまとめて良いか途方に暮れそうになる。しかし、始めてみると意外に作業が進むもの。それに、作業が進むと今まで見えなかったものが見えたりして研究が楽しく感じられるようになってくる。良い意味で「正のフィードバック」がかかる。取っ掛かりが重要なんだなぁ…この勢いでゼミの準備を終わらせなければならない気がする。そうしないと、中途半端になってしまいそうだ。ゼミが終わった後も、このペースを維持すれば今年中に論文が書けるかもしれない。年を取るにつれ、時間が経つのを早く感じるようになってきた。同じようなことを言っていた人がいたと思うので、たぶん一般的なことだろう。実際はやらなければならないことが増えていくからなのかもしれないが…厳しい世界を生き抜くためには、研究のペースを上げるべき！その先には、今まで見えなかったものが見えてきて、研究の究極的な目標に近づけるかもしれない。
2007.11.10
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ゼミ発表まであと１週間
研究室のゼミ発表が迫ってきた。それなのにまだ解析がほとんど終わっていない。１ヶ月前から準備しているのに…新しい方法がなかなかうまくいかないのだ。ちょっとデータの取り方が悪かったのかもしれない。それに、パソコンの画面を見ながらチェックしていく方法なので眼が疲れる。だから、長時間連続の作業は出来ない。他にもしなければならない作業がある。それは、19世紀から20世紀初頭の新種記載論文の解読。この頃の論文には、英語だけでなくドイツ語やフランス語で書かれているものも多い。分類学では過去の新種・新亜種記載論文をレビューすることが必要な場合がある。古い文献を調べることがあるというのは、生物学の中では珍しい分野だ。過去の論文をレビューすることには、分類体系の変遷を知り現在使われている学名が有効かどうかを検討する、これまで種のどんな特徴が重要とされてきたかを知るという意味がある。他にも理由があるかもしれない。それと、古い文献を調べるのにはあまり研究が進んでいないという理由もある。暇なときだとこういう作業は現行の分類の歴史的背景が分かって楽しいのだが、時間が無いとなかなか出来ない。この論文のレビューは発表のイントロ・ディスカッションと深く関わってくる。もうちょっと時間があれば面白い話が組み立てられそうなのだが…ゼミが終わるまで、論文を書く時間がない！でも半年にたった１回のゼミ発表だから我慢。
2007.11.05
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