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ちぇブラとはロシアの大人気人形アニメ「チェブラーシカ」のことです。映画チェブラーシカを見て、彼の無垢さと無力さに感動しました。ちぇブラで行こうっていうのは、つまりチェブラーシカみたいに「手ぶら」で行ってみようっていう感じです。
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2013.03.26
カテゴリ： オーディオ・PC・Linux
ここ数日の成果 Linux関連
Vine Linux 6.1 X86_64 (64bit)導入
OptiPlex 9010スモールシャーシ、に、Core i7-3770 3.4GHz 8GBメモリといったところ。
これに、Vine Linux 6.1 X86_64 (64bit)導入する。グラフィックボードは新設せずに行ったが、インストールは完了したもよう。
旧マシンからネット越しに数100GBにわたるデータを転送して完了。
intel compilerの導入
non-commercial licenseを導入。
cyana compileと最適化
cyanaを64bit版のifortでcompileする。
今回、staticにせず、i_dynamicオプションでライブラリを動的にリンク。
当初O3/SSE4.2のオプションをたてていたがやや挙動がおかしかったので、SSEは使用中止、O2の最適化でとめておくと・・・
旧マシン→（Core i7 860 2.8GHz）で7分かかっていた計算が2.5分、およそ2.5倍の高速化を達成した
cns_solve_1.21の導入
x86_64で最適化されたバイナリーが配布されているのがこの版だったので、最新版1.3ではなくこちらを導入。計算速度を比較
Core i7-3770 : anneal1.inp → 703.8 seconds
Core i7-860 : anneal1.inp → 1548.92 seconds
これは64bit効果とバイナリ最適化といろいろ理由が考えられるが、それでも、クロック数以上の高速化(2.1倍達成）がなされている。嬉しい限りである。
nmrpipe導入
CD-ROMよりnmrpipe / nmrdrawを導入、これは問題なし
xpdf導入
これはソースよりビルドする。
原因不明でうまくいかない。そのうち対処する。とりあえず、pdftotextについてだけはインストールできたので、それを次項、namazu検索サーバ立ち上げに資する。
namazuによるPDF全文検索環境整備
前PCから移植した、piyotaの研究資産ともいえる、これまでのDLした学術論文のPDFアーカイブ。これが収載されたディレクトリを対象に、namazuを利用してインデックスをつける。デフォルト設定がないので、なにやら微妙に旨く行かないが、あちこちいじっているうちに上手くいくようになった。やれやれ。やれやれ。
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