2012年04月の記事
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釣り（阿納）と焼肉と
釣り（阿納ブルーパークの無料堤防）本日仕込んだえさ・アオイソメ一杯 → 結局どの魚も興味を示さず・パックの冷凍オキアミＭ → メジナ興味示すも食い渋い・キビナゴ → ガシラ類が食ってくるかと思ったがまったく興味なし・グレパワー → 釣りボックス内に眠っていたものを半分だけ投入、アミなど混ぜず。本日出した竿・Ｊ専用竿で落とし込み（ズボ） → 食い渋い。何も釣れず。・1.5mヘチ竿で落とし込み（ズボ）→ 同上、えさをとられるだけで何も釣れず。・途中釣具屋で一本1050円の3.6mグラス万能竿を購入。早速実戦投入 → 浮き釣りでメジナ・ガシラ・スズメダイをゲット。状況遠くでしょっちゅう大型ボラがはねている。気温25度くらい、すごしやすい。晴れ→うす曇、風はなく釣りやすい。ただし、水温が低いのか、活性は低い。こませをまくと、やや反応があり、堤防中腹で、足元にメジナ・スズメダイが寄るのが見える。オキアミを混ぜてやるとメジナがオキアミを食うが、水温が低いのかボイルはしない。食いも渋い渋い。ただし、群れている木っ端メジナのさらに底には30cm級のメジナの魚影も見える。実際、後から来た釣り客は、紀州釣りを仕込んでいた。底に寄っている大物を狙うのであろうか？本日の成果：木っ端メジナ ４ ガシラ １ スズメダイ ２ 大半はJの成果です、念のため。2009年の阿納の釣り記録なお昨年のGWはT君一家と平磯に出撃、貧果に泣いた。宝牧場焼肉「釣りに行くと焼肉がとってもたべたくなるのよね～」ひどいYokotaである。でも今回は、言ってみたい焼肉レストランがあるのだ！そう、前回天空の湯に入りにいったときに目星をつけていた、朽木の宝牧場隣接の焼肉レストラン「宝亭」である。お昼ごはんを昨日の残り物のいなりずしとパンくらいしか食べていない我らは、5時過ぎといえどもすでに腹ペコ。レストランにいくと空席はあるものの7時からの予約のお客様で一杯だといわれる。だがまだ1時間30分はある。大丈夫！焼肉いってみよう！というわけで、ファミリーセットに、肉数皿を追加、アルコールフリービールとジュースでみんなで乾杯、ほかに雑炊など。大満足である。しかもデザートにはソフトクリームを食べ、おもたせにバームクーヘンをもらって・・・ご機嫌！ というところで、事件は起きた。食後、駐車場で店から車まで帰る途中で、店の植え込みの石垣の上を歩いて遊んでいたNちゃんが、ジャンプしようとして、こけて、頭から落ちて、号泣！！あらあらあら・・・・結局、おでこと鼻の頭をすりむくという、怪我で一日が終わる。やれやれである。ブログ村で阿納ブルーパークのブログを探してみる
2012.04.28
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Perlで多次元配列がいじれるらしい
昨晩、遅くまでNMR測定していたので、今朝は神戸からの出勤。昼過ぎ、とある西神戸の実験機器メーカーの人（もと大学院生のひと）が面白い試料をもって遊びにきてくれる。なかなか面白い試料だなあ。で、そのあと３時間以上かかって会議があって、それが終わってからデスクワークをこなして・・・・そして。ひさしぶりにPerlのスクリプトで遊んでみるO先生に依頼された天然変性タンパク質の統計解析の続きが気になったので自宅でLinuxをいじりはじめたのであった。で、例の解析を二面角座標空間に拡張してみたらどうなるかというのを考えた。で、どうやればいいのかと考えたとき、割と簡単にPDBをPHI/PSIだけの二面角座標に書き換える応報を思いついたので試してみたら、うまくいったのでここにかいておく。(1)PDBファイルを主鎖heavy atomだけにする(gawkを使う)(2)それをmolmolで読み込ませる(3)WriteAngでDYANA形式二面角ファイル(*.cor format)に書き出すと、PHI/PSIの表になっているのであった。実際にはshell scriptを使って、まず全てのファイルに対して処理を行うmolmolのマクロを作成して、molmolを1回だけ立ち上げてXUserMac で一撃である。あとは、Perlで二次元配列をつくれるというのと（こんなかんじ my @Array = ();$Array[0][0] = "a";$Array[0][2] = "b";$Array[1][1] = "c";$Array[2][0] = "d";$Array[2][3] = "e";）総和や平均や標準偏差を計算する簡単な関数をウェブ上で手に入れたということとmore math.pl test.pl::::::::::::::math.pl::::::::::::::package math;sub sum{ my $sum=0; $??????@_; for($i=0;$i<$n;$i++){ $sum+=$_[$i]; } return($sum);}sub mean{ $goukei=sum(@_); $??????@_; $mean=$goukei/$n; return($mean);}sub var{ my $mean=mean(@_); my $??????@_; my $sum=0; for($i=0;$i<$n;$i++){ $sum+=($_[$i]-$mean)**2; } $var=$sum/($n-1); return($var);}sub stdev{ my $var=var(@_); $sd=sqrt($var); return($sd);}1;::::::::::::::test.pl::::::::::::::#!/usr/bin/perl@dat=(1,2,3,4,5,6,7,8,9,10);require("/home/piyota0/JUNK/120410/math.pl");my $x=math::sum(@dat);my $y=math::mean(@dat);my $z=math::var(@dat);my $a=math::stdev(@dat);print $x, " ", $y, " ",$z, " ",$a,"\n";1;具体的にはこの二つでなんなく実現できそうである。ちなみにN末端C末端の残基にはそれぞれPSI/PHIしかないのとPROにもPSIしかないことに注意すべし。わーいブログ村で田舎暮らし・自然満喫のブログを探してみる
2012.04.19
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再び花見
再び花見最高気温が20℃まであがり、ポッかポカの花見日和である。というわけで、東山公園。平日なのになぜかかなり混んでいる。期間中、迷子のアナウンス二件。両親は浮かれてちゃだめだ。大学院生△□さんが、お酒を飲んでしまったにもかかわらず、ラボにもどってからトランスフォーメーソンをするというので、酔った頭に間違った情報をインプットすべく「ヒートショックは45℃でしかも二分」とか「抗生物質はテトラサイクリン」とか微妙に間違った情報をささやき続けていたら、まじで怒られた。ごめんよ。ブログ村で田舎暮らし・自然満喫のブログを探してみる
2012.04.10
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鴨川のヌートリア
花見本日は花見日和である。自転車でデルタと葵橋西詰の間くらいに向かう。定番の花見場所である。手土産は北大路で買った黒蜜だんご。さて、河原にいくと変な生き物が人見知りもせずに寄ってきた。こどもヌートリアである。巣があるらしい。JもNも興味しんしんで、ほっておくとNが川にぼっちゃんするので、Nはとりあえず捕捉して陸地に撤収する。抵抗して両足をじたばたさせる。ヌーちゃんが気に入ったらしい。あとでもう一度見てみたら、親と思しき小型犬くらいのおおきさのヌーちゃんが、河原に散歩に来た人からパンくずをもらっていたので、餌付けされているのであろう。ブログ村で蛋白質立体構造関連のブログを探してみる
2012.04.08
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眼鏡を新調する ツボダイを喰らう
眼鏡を新調した実際には新調したのは先週なのだが、できあがったのを取りにいくのが今日なのである。というわけで北白川通りの某チェーン店の眼鏡屋へ。で、その日の朝、悲劇が起ったのである。まず、昨日まで出張だったせいで、疲れが完全にとれていないために、明け方、なんだかいやな夢をみた。で、あわててトイレに起きた時に、同じ布団にもぐりこんできていたNの足を踏みかけた。体重をかけたらまずいので、回避しようとして、こむら返りが起きて、バランスを崩し、まくらもとにあった、旧眼鏡を踏んでしまった、というわけである。Michael Jordiの眼鏡フレーム（国内非売品）についに引導を渡してしまったのであった（号泣）。ところで、最近思うのだが、京都北部の眼鏡屋には、いつも近所の（なのか常連のなのか）ご老人のお客様が、とくに何かを買うわけでもなく、店員さんにあれやこれや相談して、健康食品の試食をしたり、時間を潰している（ように見える）。前回、フレームとレンズを買いに来た時も一名いたし、今日も別の老人客が一人いた。少子高齢化を迎え、とくに京都市北部は町全体が高齢化している。そういうところで、コンシューマ向けの事業を展開するというのは、なかなか大変なのだなあ。スタジオで記念撮影眼鏡を新調したあとは、市内某所の子供記念写真専門館で、Ｊの晴れ姿の記念撮影である。ついでにＮも入れて家族記念写真。ツボダイを喰らう写真(上)は昨日食べたカニ。写真(下)は、カニと一緒に買ったツボダイ（大）の干物。今日の夕食はこれを焼いて食べることにする。かなり大きな干物で食べがいがあるのだが、今回はみずみずしくふっくら焼けたので、ＪもＮも大満足でがつがつぱくぱく食べる。干物をおいしく焼くのにコツというほどでもないが、Piyotaはコンロのグリルを使うときに、途中で火をとめて余熱で加熱するようにしている。中火で４分やいて、火をとめて４分、余熱で中まで熱して、最後に仕上げ２～３分くらい、焼きすぎない、ぱさぱさにしない、というのが、コツといえばコツか。ブログ村で田舎暮らし・自然満喫のブログを探してみる
2012.04.01
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