piyotaの【ちぇブラで行こう】

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piyota0

ちぇブラとはロシアの大人気人形アニメ「チェブラーシカ」のことです。映画チェブラーシカを見て、彼の無垢さと無力さに感動しました。ちぇブラで行こうっていうのは、つまりチェブラーシカみたいに「手ぶら」で行ってみようっていう感じです。

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2011.05.18

MOLMOLがWindows上で動かない

動かない
正確にいうと、動くけれども表示がおかしい
どうおかしいのかというと3D表示がおかしいのである
hidden surface eliminationのフラグを立てると、挙動がおかしくなって立体構造の画面表示がでなくなる
線画レベルならば無問題である
そういう状態でころころ分子をまわしていると気持ち悪くなる

これはWinXPの一部でも問題が出ているようなので、プログラムビルド時のグラフィックエンジンの問題と思われるのだが・・・咄嗟には対応できない。しかたない実習でMOLMOL使うのは、あきらめよう。

「MOLMOLがなくてもCueMol2があるじゃない？」
というわけでCueMol2をインストール

パブリケーショングレードのきれいな美麗な立体構造図がサクサクできる。
一つ問題なのは、IdeaPad上では13.3インチWXGAの液晶で、1366x768の表示で、左端一列にならぶメニューが非常に手狭で、機能メニュー一つをあけるたびに、他のメニューを手動ですべてとじないと、使えないこと。このメニュー2行になりませんかね？

Modeller ver 9.9 実習
まずPysonのお勉強をして、新たにかわったModellerの機能のお勉強をして、テキストを参考にデモで計算を流す。サクサクと計算が進み、ホモロジーモデルができる。

むしろ無理があるのはWindows XP備え付けの機能、たとえばメモ帳とかワードパッドとかで、配列ファイルやPDBの生の形式のファイルを編集したり改変したりすることである。改行コードとか、スペースとか、細かい問題で、簡単にエラーが起こるので要注意である。やれやれである。 Girly !!