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2011.05.27
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カテゴリ: 生命科学

細胞生物学の簡単な講義



今日はビジュアルに楽しくをモットーに、タミフルその他とneuramidaseとの複合体の構造を堪能していただき、それから、YouTubeから仕込んだAda Yonath先生ご監修の例のうごうごリボゾームアニメ二篇をご鑑賞いただく。それからタンパク質精製の方法論について、詳細に説明。構造決定法については説明できなかった、なにやってるんじゃ。まあしょうがない。

来客
超高磁場NMRの使い道 について、B社のSさんが来訪くださったので、一緒にご議論いただいた。

構造生物学のおかれた現状
・構造生物学「そのもの」の方法論はこの10年間まったく進歩進展がないこと
・構造生物学の方法論、とくに構造決定法には著しい進歩があったこと
・NMRにおいては、構造生物学にかかる装置のコストとその運用コストは、むしろ高くなっていること

構造生物学系研究室をとりまく環境の変化とその結果
・前述のように「コスト」があがった。
・タンパク質の立体構造自身が持つ本来の価値(使い道)は、10年間上がるわけではなく横ばいのまま
・より難易度の高いタンパク質の構造は到達可能になった
・もともと難易度の高くない水溶性のタンパク質の構造は、簡単に決定可能になった
(それでもまったくルーチンというわけではない)
   ↓
その結果、立体構造情報の持つ、研究者社会に於ける相対的価値(希少性・重要性)は下落した。
   ↓
価値が下落したのに、コストはいうほど下がらなかった(場合によってはあがった)ので、コスト割れが起きて、PIにとってラボ運営をビジネスに例えた場合の「拡大再生産」どころか「現状維持」すら困難になり、マイナスのスパイラルに陥っていきつつある。
   ↓
そのせいで、そういう「価値観」(景況感)に敏感な若手の研究者が流動・流出し、NMR構造生物学の研究者人口は減った(しかもまだ減りつつある)

なんとも暗い現状分析だなあ、やれやれ。だがめげてはいけない。上記のような現状認識とこれまでの構造生物学の歴史からの反省は、これからつくる予定(脳内)のPiyotaラボのポリシーに反映させることにする。

Piyotaラボのポリシー として、「創薬のための立体構造決定」というような安直な作文は慎む。そのかわり、もし創薬目的で構造決定をするのならば、後述のように、 「とことん」やる 。

そのこころはというと、安直な「創薬のための立体構造決定」のような作文には、かなりの嘘がある、と思うのである。もし本当に創薬のための立体構造決定を歌うならばアステラス阪下先生グループを見習って、ケミストのグループと手を組んだ、「低分子複合体との構造」それもハイスループット構造決定に特化すべきである。それがもっとも創薬に役立つんだから。

PiyotaラボのもうひとつのNMR研究のポリシー として、
高磁場ならではの使い道、という切り口は必要だが、それを「緩和」「NMRダイナミクス」のような分野には 誘導しない ことにする。タンパク質の動的構造研究は、分野としての波及効果が割と限定的な(というか事前に直感的に評価できない)マニアックな学問なので。情報という観点からすると、「タンパク質動的構造情報」というのは、まだまだ需要を十分引き出していないのではないか、といういい方もできる。現時点ではPiyotaにはグッドアイデアはないので、いいアイデアが閃くまでお預け、それまでは距離をおくという程度の意味である。決して学問として否定しているわけではない。

おまけ
高磁場NMRの学問におけるそれなりに有用な使い方を考える上で、 中部地域でのネットワーク形成は重要 、と思われる。

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最終更新日  2011.07.07 15:52:25
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