より良い医療実現の為の改革を目指し、闇深い医療界の頂点に立つことを決意した明鏡医科大学付属病院心臓外科医、白鳥稔（佐々木蔵之介）教授が暴走。藤巻達臣（反町隆史）が発見し密かに培養していた殺人球菌「ギフト」を使い、理事長の奥野信二（坂東彌十郎）を殺害。そのまま次期理事長に納まる白鳥。藤巻の教授昇格を約束。――「ギフト」により死亡した二人（愛宕克己、安田勝）と同様、奥野も急性心不全が死因とされ、白鳥の目論見は見事に成功。が、警視庁元捜査一課刑事、神林育人（尾上松也）は、奥野理事長の行政（司法）解剖を他の大学病院の剣持教授に依頼。

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重い心臓病で入院する妻、藤巻麻帆（明日海りお）の手術執刀を盾に、白鳥から「ギフト」という殺人球菌の証拠隠滅を命じられた藤巻は、良心の呵責に苛まれながら、解剖される遺体に残るギフト球菌の消滅に努めます。そこに白鳥からの更なる指令として、「私の球菌を勝手に使いましたね。代償を払っていただきます」という脅迫状を書いた真犯人を特定せよと言われます。

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神林同様に奥野理事長の死に疑念を抱く検査技師、久留米穂希（波瑠）が藤巻に接近。急性心不全で他界したとされている安田勝の妻、梢（松山尚子）が亡き夫の跡を引き継いでいる居酒屋で、「藤巻先生は、球菌を持ち込んだ真犯人を知っているはず。誰なのか教えて下さい」と迫ります。「知りません」と藤巻。ともあれ、話の流れで穂希が殺人球菌の培養を手伝うことになります。殺人兵器の証拠物として是非残そうということになります。で、藤巻は、穂希が執拗に球菌を持ち込んだ真犯人を追及している件を白鳥に報告すべきが迷った挙句、場合によっては穂希が白鳥に殺されてしまう可能性を思い、報告しません。そんな時、不審な心筋梗塞死の患者が発生。が、それはギフト球菌が死因ではなく、胸を撫で下ろす藤巻。

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奥野理事長の死について、「事件性なし」と解剖医の剣持教授が判断。が、元捜査一課刑事の神林はこれを殺人と考え、藤巻の元にやって来ます。神林は独特のカンで、白鳥が奥野殺しと確信しています。で、藤巻に「白鳥に不審な動きがあったら連絡して欲しい」と言って帰ります。

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病理医の伊集院薫（盛山晋太郎）が、「殺人球菌のことでお話があります。地下駐車場に来てください」と藤巻を呼び出し。伊集院がそもそも球菌を持ち込んだ真犯人かとも思われますが、彼は、ただ白鳥から金を巻き上げようとしているだけであり、「白鳥を脅して一億円を奪おう」と藤巻に持ち掛けます。伊集院は藤巻が球菌を培養しているのを見ていて、それが白鳥の命によるものと知っています。「年度予算は理事長が握っている。そのお零れを貰うだけ。真犯人からの脅迫文だと言ってそれを示し、一億円を貰う。あなたは既に球菌を培養していて人殺しに加担している。今更、善人面するな。嫌なら警察に通報するし、それで奥さんの手術もダメになる。どうする?　……奪った金は折半する」ということで、伊集院の申し出を断れない藤巻。

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