地下研究所 HIVE での事件後、 アンブレラ社 の部隊はT-ウイルスの生みの親 チャールズ博士 とその家族を保護する。しかし、博士の娘 アンジェラ は交通事故に巻き込まれてしまう。その頃、ラクーンシティーの特殊部隊 S.T.A.R.S に所属している ジル・バレンタイン はラジオとテレビでラクーンシティで起きている惨事を聞くと警察署へと向かった。
ジルは警察署にいる ゾンビ を射殺する。その時、アンブレラ社の ティモシー少佐 は、 アリス計画 を始動。すると、ラクーンシティ病院に監禁されている アリス が目を覚ます。アリスは病院を出ると街は 静寂 に包まれていた。一方、ジルはラクーンシティの出口ゲートに向かうが、そこは多くの市民で溢れ返っていた。
さらに、街の外へ行く唯一のゲートがアンブレラ社によって封鎖されてしまうのだった。アンブレラ社の部隊に所属している カルロス はゾンビの進行を防いでいた。しかし、弾薬が尽きて撤退している途中でゾンビに噛まれてしまう。
チャールズ博士は、娘の所在を掴むためにアンブレラ社のシステムをハッキングし、監視カメラで生存者を探し始めるとカメラに映ったアリスを発見する。アリスは武器屋に入り、銃装備を整える。その時、昏睡状態だった時の記憶がフラッシュバックし、自身に T-ウイルス を大量に投与されたことを思い出すのだった・・・。
ゲームにも登場するキャラクターのジルとカルロスが登場します。さらに、ゲーム『バイオハザード3』で出てきた ネメシス も登場。3で奴に苦労させられたプレイヤーも多いんじゃないでしょうか。（私ですｗ）今作も 派手な戦闘シーン や アクション が満載!!
